Protein–RNA interactions for Protein: P43345

Tlx1, T-cell leukemia homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx1P43345 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tlx1P43345 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tlx1P43345 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tlx1P43345 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tlx1P43345 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tlx1P43345 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tlx1P43345 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tlx1P43345 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tlx1P43345 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tlx1P43345 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tlx1P43345 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tlx1P43345 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tlx1P43345 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms