Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VhlP40338 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VhlP40338 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VhlP40338 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VhlP40338 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VhlP40338 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VhlP40338 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VhlP40338 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VhlP40338 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VhlP40338 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VhlP40338 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VhlP40338 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VhlP40338 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VhlP40338 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VhlP40338 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VhlP40338 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VhlP40338 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VhlP40338 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VhlP40338 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VhlP40338 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VhlP40338 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VhlP40338 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VhlP40338 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VhlP40338 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VhlP40338 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
VhlP40338 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VhlP40338 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VhlP40338 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VhlP40338 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VhlP40338 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VhlP40338 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VhlP40338 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VhlP40338 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VhlP40338 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VhlP40338 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VhlP40338 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VhlP40338 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VhlP40338 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VhlP40338 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VhlP40338 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VhlP40338 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VhlP40338 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VhlP40338 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VhlP40338 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VhlP40338 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VhlP40338 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VhlP40338 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VhlP40338 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VhlP40338 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VhlP40338 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VhlP40338 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VhlP40338 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VhlP40338 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VhlP40338 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VhlP40338 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VhlP40338 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VhlP40338 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VhlP40338 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VhlP40338 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VhlP40338 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VhlP40338 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VhlP40338 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VhlP40338 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VhlP40338 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VhlP40338 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VhlP40338 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VhlP40338 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VhlP40338 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VhlP40338 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VhlP40338 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VhlP40338 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VhlP40338 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VhlP40338 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VhlP40338 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VhlP40338 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VhlP40338 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VhlP40338 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VhlP40338 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VhlP40338 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VhlP40338 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VhlP40338 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VhlP40338 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VhlP40338 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VhlP40338 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
VhlP40338 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VhlP40338 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VhlP40338 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VhlP40338 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VhlP40338 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VhlP40338 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VhlP40338 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VhlP40338 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VhlP40338 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VhlP40338 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VhlP40338 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VhlP40338 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VhlP40338 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VhlP40338 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VhlP40338 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VhlP40338 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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