Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grik2P39087 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grik2P39087 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grik2P39087 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grik2P39087 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grik2P39087 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grik2P39087 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik2P39087 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms