Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TtlP38585 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TtlP38585 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TtlP38585 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TtlP38585 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TtlP38585 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TtlP38585 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TtlP38585 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TtlP38585 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TtlP38585 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TtlP38585 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TtlP38585 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TtlP38585 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TtlP38585 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TtlP38585 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TtlP38585 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TtlP38585 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TtlP38585 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TtlP38585 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TtlP38585 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TtlP38585 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TtlP38585 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TtlP38585 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TtlP38585 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TtlP38585 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TtlP38585 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TtlP38585 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TtlP38585 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TtlP38585 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TtlP38585 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TtlP38585 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TtlP38585 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TtlP38585 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TtlP38585 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TtlP38585 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TtlP38585 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TtlP38585 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TtlP38585 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TtlP38585 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TtlP38585 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TtlP38585 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TtlP38585 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TtlP38585 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TtlP38585 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TtlP38585 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TtlP38585 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TtlP38585 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TtlP38585 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TtlP38585 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TtlP38585 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TtlP38585 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TtlP38585 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TtlP38585 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TtlP38585 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TtlP38585 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TtlP38585 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TtlP38585 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TtlP38585 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TtlP38585 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TtlP38585 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TtlP38585 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TtlP38585 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TtlP38585 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TtlP38585 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TtlP38585 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TtlP38585 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TtlP38585 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TtlP38585 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TtlP38585 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TtlP38585 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TtlP38585 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TtlP38585 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TtlP38585 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TtlP38585 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TtlP38585 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TtlP38585 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TtlP38585 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TtlP38585 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TtlP38585 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TtlP38585 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TtlP38585 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TtlP38585 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TtlP38585 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TtlP38585 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TtlP38585 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TtlP38585 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TtlP38585 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TtlP38585 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TtlP38585 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TtlP38585 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TtlP38585 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TtlP38585 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TtlP38585 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TtlP38585 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TtlP38585 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TtlP38585 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TtlP38585 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TtlP38585 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TtlP38585 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TtlP38585 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms