Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpargP37238 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpargP37238 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpargP37238 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpargP37238 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpargP37238 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpargP37238 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpargP37238 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpargP37238 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpargP37238 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PpargP37238 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpargP37238 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpargP37238 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpargP37238 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpargP37238 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpargP37238 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PpargP37238 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpargP37238 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpargP37238 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpargP37238 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpargP37238 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpargP37238 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpargP37238 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpargP37238 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpargP37238 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpargP37238 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpargP37238 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpargP37238 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpargP37238 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpargP37238 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpargP37238 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpargP37238 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpargP37238 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpargP37238 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PpargP37238 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PpargP37238 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpargP37238 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpargP37238 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpargP37238 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpargP37238 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpargP37238 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpargP37238 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpargP37238 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpargP37238 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpargP37238 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpargP37238 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpargP37238 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpargP37238 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpargP37238 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpargP37238 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpargP37238 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpargP37238 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PpargP37238 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PpargP37238 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PpargP37238 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PpargP37238 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PpargP37238 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PpargP37238 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PpargP37238 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PpargP37238 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PpargP37238 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PpargP37238 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PpargP37238 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PpargP37238 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PpargP37238 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PpargP37238 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PpargP37238 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PpargP37238 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PpargP37238 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PpargP37238 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PpargP37238 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PpargP37238 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PpargP37238 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PpargP37238 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PpargP37238 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PpargP37238 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PpargP37238 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PpargP37238 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PpargP37238 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PpargP37238 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PpargP37238 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PpargP37238 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PpargP37238 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PpargP37238 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PpargP37238 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PpargP37238 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PpargP37238 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PpargP37238 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PpargP37238 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PpargP37238 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PpargP37238 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PpargP37238 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PpargP37238 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PpargP37238 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PpargP37238 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PpargP37238 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PpargP37238 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PpargP37238 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PpargP37238 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PpargP37238 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms