Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddit3P35639 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms