Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Grin1P35438 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grin1P35438 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grin1P35438 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grin1P35438 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grin1P35438 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grin1P35438 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grin1P35438 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grin1P35438 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grin1P35438 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grin1P35438 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grin1P35438 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Grin1P35438 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grin1P35438 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grin1P35438 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grin1P35438 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Grin1P35438 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Grin1P35438 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grin1P35438 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grin1P35438 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grin1P35438 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grin1P35438 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grin1P35438 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grin1P35438 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grin1P35438 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grin1P35438 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grin1P35438 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grin1P35438 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grin1P35438 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grin1P35438 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grin1P35438 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grin1P35438 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grin1P35438 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grin1P35438 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grin1P35438 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grin1P35438 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grin1P35438 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Grin1P35438 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grin1P35438 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grin1P35438 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grin1P35438 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grin1P35438 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Grin1P35438 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grin1P35438 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grin1P35438 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grin1P35438 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grin1P35438 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grin1P35438 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grin1P35438 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grin1P35438 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grin1P35438 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grin1P35438 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grin1P35438 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grin1P35438 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grin1P35438 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grin1P35438 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grin1P35438 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grin1P35438 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grin1P35438 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grin1P35438 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grin1P35438 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grin1P35438 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grin1P35438 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grin1P35438 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grin1P35438 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grin1P35438 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grin1P35438 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grin1P35438 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grin1P35438 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Grin1P35438 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grin1P35438 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grin1P35438 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grin1P35438 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grin1P35438 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grin1P35438 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms