Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5cP35278 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Rab5cP35278 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Rab5cP35278 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Rab5cP35278 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5cP35278 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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