Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msr1P30204 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msr1P30204 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msr1P30204 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msr1P30204 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msr1P30204 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msr1P30204 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msr1P30204 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msr1P30204 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms