Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RxrgP28705 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RxrgP28705 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RxrgP28705 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RxrgP28705 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RxrgP28705 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RxrgP28705 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RxrgP28705 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RxrgP28705 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RxrgP28705 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms