Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb1P28230 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms