Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjc1P28229 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms