Protein–RNA interactions for Protein: P28033

Cebpb, CCAAT/enhancer-binding protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpbP28033 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CebpbP28033 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CebpbP28033 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CebpbP28033 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CebpbP28033 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CebpbP28033 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CebpbP28033 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CebpbP28033 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CebpbP28033 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CebpbP28033 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CebpbP28033 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CebpbP28033 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CebpbP28033 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms