Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pde6aP27664 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms