Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PdgfraP26618 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfraP26618 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms