Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
U2af2P26369 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
U2af2P26369 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
U2af2P26369 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
U2af2P26369 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
U2af2P26369 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
U2af2P26369 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
U2af2P26369 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms