Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cdk11bP24788 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms