Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd247P24161 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd247P24161 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd247P24161 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd247P24161 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd247P24161 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cd247P24161 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cd247P24161 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd247P24161 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd247P24161 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd247P24161 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms