Protein–RNA interactions for Protein: P23979

Htr3a, 5-hydroxytryptamine receptor 3A, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr3aP23979 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htr3aP23979 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms