Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 AC167977.2-201ENSMUST00000225676 682 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Tpt1-ps1-201ENSMUST00000120257 436 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm13754-201ENSMUST00000120486 998 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Mup-ps22-201ENSMUST00000121611 243 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 2210414B05Rik-201ENSMUST00000139600 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm16589-201ENSMUST00000159522 918 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm21970-201ENSMUST00000160764 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm29064-201ENSMUST00000187014 813 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Sox2ot-214ENSMUST00000198758 1286 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm42640-201ENSMUST00000199792 1195 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm2788-205ENSMUST00000209849 933 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 AC127302.1-201ENSMUST00000215973 1111 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 AC154765.1-201ENSMUST00000217732 439 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 A730045E13Rik-201ENSMUST00000066740 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Vmn1r198-201ENSMUST00000091733 903 ntAPPRIS P2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm3675-201ENSMUST00000175904 1653 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm14599-201ENSMUST00000120469 474 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm15956-201ENSMUST00000153352 502 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm18588-201ENSMUST00000177308 492 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm28703-201ENSMUST00000185312 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm28935-201ENSMUST00000185737 568 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm38254-201ENSMUST00000192276 1009 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm17935-201ENSMUST00000196649 772 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm43905-201ENSMUST00000204516 204 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm19137-201ENSMUST00000213790 1164 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 AC130823.2-201ENSMUST00000226169 290 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 CT009550.5-201ENSMUST00000226286 382 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 AC115784.1-201ENSMUST00000227687 1010 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Olfr979-201ENSMUST00000080835 1045 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Gm42970-201ENSMUST00000196407 1352 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Gm24532-201ENSMUST00000157951 286 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Ms4a2-202ENSMUST00000164792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Gm26723-201ENSMUST00000180771 787 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Ms4a2-205ENSMUST00000189641 647 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Gm43342-201ENSMUST00000201027 924 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Gm45344-201ENSMUST00000211610 341 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Olfr950-ps1-201ENSMUST00000213804 878 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 AC152979.4-201ENSMUST00000219893 379 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Dapl1-201ENSMUST00000028369 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Tas2r106-201ENSMUST00000076756 927 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Vmn1r201-201ENSMUST00000091730 903 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Tex9-214ENSMUST00000184831 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Gm35963-201ENSMUST00000211762 1425 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Gm7416-201ENSMUST00000117448 1487 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Smim9-201ENSMUST00000101433 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Gm12387-201ENSMUST00000118573 955 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Obox1-206ENSMUST00000181001 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 AC123835.1-201ENSMUST00000214362 670 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 AL603630.1-201ENSMUST00000214781 147 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 AC159476.2-201ENSMUST00000216221 418 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms