Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZfaP23607 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZfaP23607 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZfaP23607 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZfaP23607 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZfaP23607 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZfaP23607 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZfaP23607 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms