Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd8P23463 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms