Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrkchP23298 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkchP23298 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkchP23298 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkchP23298 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkchP23298 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkchP23298 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrkchP23298 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrkchP23298 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrkchP23298 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrkchP23298 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PrkchP23298 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms