Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Eif3aP23116 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Eif3aP23116 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms