Protein–RNA interactions for Protein: P22387

Edn1, Endothelin-1, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn1P22387 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Edn1P22387 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Edn1P22387 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Edn1P22387 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Edn1P22387 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Edn1P22387 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Edn1P22387 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Edn1P22387 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Edn1P22387 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms