Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

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Length 672 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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