Protein–RNA interactions for Protein: P19536

Cox5b, Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox5bP19536 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Cox5bP19536 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cox5bP19536 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cox5bP19536 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cox5bP19536 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cox5bP19536 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cox5bP19536 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cox5bP19536 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cox5bP19536 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cox5bP19536 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cox5bP19536 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cox5bP19536 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cox5bP19536 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cox5bP19536 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cox5bP19536 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cox5bP19536 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms