Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NelfeP19426 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NelfeP19426 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NelfeP19426 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NelfeP19426 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NelfeP19426 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NelfeP19426 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms