Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifrd1P19182 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms