Protein–RNA interactions for Protein: P18527

Ig heavy chain V region 914, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18527 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P18527 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
P18527 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P18527 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P18527 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P18527 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
P18527 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P18527 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P18527 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P18527 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P18527 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P18527 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P18527 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
P18527 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
P18527 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
P18527 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
P18527 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P18527 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
P18527 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P18527 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
P18527 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P18527 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P18527 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P18527 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P18527 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P18527 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P18527 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
P18527 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P18527 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P18527 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P18527 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
P18527 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
P18527 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P18527 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P18527 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
P18527 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
P18527 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
P18527 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P18527 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P18527 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P18527 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
P18527 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P18527 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P18527 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P18527 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P18527 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P18527 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P18527 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
P18527 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
P18527 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P18527 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
P18527 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P18527 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P18527 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P18527 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
P18527 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P18527 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P18527 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P18527 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
P18527 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P18527 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P18527 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
P18527 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
P18527 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
P18527 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
P18527 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P18527 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P18527 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P18527 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P18527 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P18527 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
P18527 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P18527 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P18527 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P18527 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P18527 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P18527 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
P18527 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P18527 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P18527 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P18527 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P18527 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P18527 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P18527 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P18527 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P18527 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P18527 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P18527 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P18527 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
P18527 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18527 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18527 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18527 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18527 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18527 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18527 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18527 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18527 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18527 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
P18527 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms