Protein–RNA interactions for Protein: P18526

Ig heavy chain V region 345, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18526 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P18526 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P18526 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P18526 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P18526 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P18526 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P18526 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P18526 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P18526 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P18526 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P18526 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P18526 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P18526 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P18526 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P18526 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P18526 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P18526 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P18526 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P18526 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
P18526 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
P18526 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P18526 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
P18526 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P18526 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P18526 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P18526 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P18526 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P18526 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P18526 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
P18526 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P18526 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P18526 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P18526 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P18526 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P18526 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P18526 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P18526 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P18526 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18526 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18526 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18526 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18526 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18526 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18526 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18526 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18526 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18526 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18526 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18526 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18526 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18526 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18526 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18526 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18526 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
P18526 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18526 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18526 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18526 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18526 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18526 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18526 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18526 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18526 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18526 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18526 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18526 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
P18526 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18526 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18526 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18526 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18526 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18526 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18526 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18526 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18526 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18526 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18526 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18526 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18526 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18526 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18526 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
P18526 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18526 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18526 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18526 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18526 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18526 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18526 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18526 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18526 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P18526 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P18526 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P18526 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P18526 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
P18526 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P18526 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18526 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18526 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18526 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18526 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms