Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata1P17679 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata1P17679 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata1P17679 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata1P17679 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata1P17679 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gata1P17679 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gata1P17679 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms