Protein–RNA interactions for Protein: P17095

Hmga1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmga1P17095 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hmga1P17095 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hmga1P17095 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hmga1P17095 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Hmga1P17095 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hmga1P17095 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hmga1P17095 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hmga1P17095 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hmga1P17095 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hmga1P17095 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hmga1P17095 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hmga1P17095 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hmga1P17095 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hmga1P17095 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hmga1P17095 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hmga1P17095 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hmga1P17095 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hmga1P17095 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hmga1P17095 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hmga1P17095 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hmga1P17095 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hmga1P17095 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Hmga1P17095 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Hmga1P17095 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hmga1P17095 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hmga1P17095 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Hmga1P17095 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hmga1P17095 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hmga1P17095 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hmga1P17095 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hmga1P17095 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hmga1P17095 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hmga1P17095 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Hmga1P17095 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hmga1P17095 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmga1P17095 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmga1P17095 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmga1P17095 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmga1P17095 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmga1P17095 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmga1P17095 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmga1P17095 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmga1P17095 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmga1P17095 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmga1P17095 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmga1P17095 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmga1P17095 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmga1P17095 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmga1P17095 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmga1P17095 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmga1P17095 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmga1P17095 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmga1P17095 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmga1P17095 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmga1P17095 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmga1P17095 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmga1P17095 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmga1P17095 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmga1P17095 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmga1P17095 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmga1P17095 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmga1P17095 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmga1P17095 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmga1P17095 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmga1P17095 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmga1P17095 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmga1P17095 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmga1P17095 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmga1P17095 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmga1P17095 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmga1P17095 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmga1P17095 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmga1P17095 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmga1P17095 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmga1P17095 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmga1P17095 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmga1P17095 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmga1P17095 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmga1P17095 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmga1P17095 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmga1P17095 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmga1P17095 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmga1P17095 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmga1P17095 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmga1P17095 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmga1P17095 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmga1P17095 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmga1P17095 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmga1P17095 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmga1P17095 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmga1P17095 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmga1P17095 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmga1P17095 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmga1P17095 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmga1P17095 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmga1P17095 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmga1P17095 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmga1P17095 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmga1P17095 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmga1P17095 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms