Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rag1P15919 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rag1P15919 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rag1P15919 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rag1P15919 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rag1P15919 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rag1P15919 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms