Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim30aP15533 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.9 ms