Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrphP15331 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrphP15331 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrphP15331 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrphP15331 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrphP15331 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrphP15331 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrphP15331 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrphP15331 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrphP15331 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrphP15331 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrphP15331 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrphP15331 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrphP15331 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrphP15331 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrphP15331 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrphP15331 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrphP15331 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrphP15331 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrphP15331 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrphP15331 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrphP15331 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrphP15331 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrphP15331 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrphP15331 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrphP15331 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrphP15331 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrphP15331 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrphP15331 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrphP15331 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrphP15331 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrphP15331 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrphP15331 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrphP15331 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrphP15331 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrphP15331 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrphP15331 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrphP15331 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrphP15331 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrphP15331 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrphP15331 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrphP15331 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrphP15331 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrphP15331 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrphP15331 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrphP15331 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrphP15331 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrphP15331 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrphP15331 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrphP15331 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrphP15331 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrphP15331 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrphP15331 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrphP15331 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrphP15331 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrphP15331 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrphP15331 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrphP15331 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrphP15331 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrphP15331 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrphP15331 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrphP15331 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrphP15331 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrphP15331 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrphP15331 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrphP15331 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrphP15331 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrphP15331 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrphP15331 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrphP15331 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrphP15331 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrphP15331 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrphP15331 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrphP15331 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrphP15331 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrphP15331 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrphP15331 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrphP15331 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrphP15331 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrphP15331 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrphP15331 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrphP15331 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrphP15331 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrphP15331 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrphP15331 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrphP15331 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrphP15331 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrphP15331 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrphP15331 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrphP15331 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrphP15331 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrphP15331 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PrphP15331 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PrphP15331 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PrphP15331 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PrphP15331 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PrphP15331 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PrphP15331 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PrphP15331 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PrphP15331 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms