Protein–RNA interactions for Protein: P13516

Scd1, Acyl-CoA desaturase 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd1P13516 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scd1P13516 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scd1P13516 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scd1P13516 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms