Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Gm8362-202ENSMUST00000170673 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Gm20822-202ENSMUST00000188422 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Gm26812-202ENSMUST00000181776 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Chrm1P12657 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Chrm1P12657 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Chrm1P12657 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Chrm1P12657 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Chrm1P12657 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Chrm1P12657 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Chrm1P12657 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Chrm1P12657 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Chrm1P12657 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Chrm1P12657 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Chrm1P12657 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Chrm1P12657 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Chrm1P12657 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Chrm1P12657 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Chrm1P12657 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Chrm1P12657 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Chrm1P12657 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Chrm1P12657 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Chrm1P12657 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Chrm1P12657 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Chrm1P12657 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Chrm1P12657 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Chrm1P12657 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Chrm1P12657 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Chrm1P12657 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Chrm1P12657 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Chrm1P12657 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Chrm1P12657 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Chrm1P12657 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Chrm1P12657 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Chrm1P12657 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Chrm1P12657 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Chrm1P12657 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Chrm1P12657 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Chrm1P12657 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Chrm1P12657 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Chrm1P12657 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Chrm1P12657 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Chrm1P12657 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Chrm1P12657 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Chrm1P12657 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Chrm1P12657 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Chrm1P12657 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Chrm1P12657 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Chrm1P12657 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Chrm1P12657 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Chrm1P12657 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Chrm1P12657 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Chrm1P12657 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Chrm1P12657 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Chrm1P12657 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Chrm1P12657 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Chrm1P12657 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Chrm1P12657 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms