Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
OtcP11725 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
OtcP11725 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
OtcP11725 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
OtcP11725 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
OtcP11725 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
OtcP11725 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
OtcP11725 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
OtcP11725 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
OtcP11725 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
OtcP11725 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
OtcP11725 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
OtcP11725 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
OtcP11725 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
OtcP11725 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
OtcP11725 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
OtcP11725 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
OtcP11725 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
OtcP11725 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
OtcP11725 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
OtcP11725 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
OtcP11725 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
OtcP11725 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
OtcP11725 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
OtcP11725 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
OtcP11725 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
OtcP11725 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
OtcP11725 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
OtcP11725 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
OtcP11725 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
OtcP11725 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
OtcP11725 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
OtcP11725 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
OtcP11725 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
OtcP11725 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
OtcP11725 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
OtcP11725 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
OtcP11725 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
OtcP11725 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
OtcP11725 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
OtcP11725 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
OtcP11725 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
OtcP11725 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
OtcP11725 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
OtcP11725 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
OtcP11725 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
OtcP11725 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
OtcP11725 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
OtcP11725 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
OtcP11725 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
OtcP11725 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
OtcP11725 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
OtcP11725 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
OtcP11725 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
OtcP11725 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
OtcP11725 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
OtcP11725 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
OtcP11725 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
OtcP11725 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
OtcP11725 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
OtcP11725 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
OtcP11725 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
OtcP11725 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
OtcP11725 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
OtcP11725 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
OtcP11725 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
OtcP11725 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
OtcP11725 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
OtcP11725 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
OtcP11725 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
OtcP11725 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
OtcP11725 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
OtcP11725 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
OtcP11725 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
OtcP11725 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
OtcP11725 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
OtcP11725 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
OtcP11725 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
OtcP11725 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
OtcP11725 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
OtcP11725 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
OtcP11725 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
OtcP11725 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
OtcP11725 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
OtcP11725 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
OtcP11725 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
OtcP11725 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
OtcP11725 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
OtcP11725 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
OtcP11725 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
OtcP11725 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
OtcP11725 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
OtcP11725 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
OtcP11725 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
OtcP11725 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
OtcP11725 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
OtcP11725 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
OtcP11725 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
OtcP11725 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
OtcP11725 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms