Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DmdP11531 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DmdP11531 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DmdP11531 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DmdP11531 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DmdP11531 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DmdP11531 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DmdP11531 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DmdP11531 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DmdP11531 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DmdP11531 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DmdP11531 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DmdP11531 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DmdP11531 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DmdP11531 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DmdP11531 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DmdP11531 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DmdP11531 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DmdP11531 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DmdP11531 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DmdP11531 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DmdP11531 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DmdP11531 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DmdP11531 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DmdP11531 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DmdP11531 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DmdP11531 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DmdP11531 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DmdP11531 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DmdP11531 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DmdP11531 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DmdP11531 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DmdP11531 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DmdP11531 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DmdP11531 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DmdP11531 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DmdP11531 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DmdP11531 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DmdP11531 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DmdP11531 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DmdP11531 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DmdP11531 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DmdP11531 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DmdP11531 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DmdP11531 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DmdP11531 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DmdP11531 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DmdP11531 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DmdP11531 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DmdP11531 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DmdP11531 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DmdP11531 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DmdP11531 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DmdP11531 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DmdP11531 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DmdP11531 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DmdP11531 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DmdP11531 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DmdP11531 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DmdP11531 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DmdP11531 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DmdP11531 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DmdP11531 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DmdP11531 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DmdP11531 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DmdP11531 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DmdP11531 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DmdP11531 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DmdP11531 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DmdP11531 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DmdP11531 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DmdP11531 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DmdP11531 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DmdP11531 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DmdP11531 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DmdP11531 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DmdP11531 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DmdP11531 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DmdP11531 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DmdP11531 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DmdP11531 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DmdP11531 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DmdP11531 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DmdP11531 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DmdP11531 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DmdP11531 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DmdP11531 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DmdP11531 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DmdP11531 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DmdP11531 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DmdP11531 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DmdP11531 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DmdP11531 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DmdP11531 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DmdP11531 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DmdP11531 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DmdP11531 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DmdP11531 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DmdP11531 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DmdP11531 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms