Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa1P11477 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa1P11477 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa1P11477 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa1P11477 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa1P11477 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa1P11477 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa1P11477 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa1P11477 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa1P11477 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa1P11477 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa1P11477 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
Defa1P11477 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms