Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PolP11369 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PolP11369 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PolP11369 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PolP11369 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PolP11369 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PolP11369 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PolP11369 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PolP11369 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PolP11369 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PolP11369 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PolP11369 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PolP11369 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PolP11369 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PolP11369 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PolP11369 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PolP11369 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PolP11369 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PolP11369 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PolP11369 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PolP11369 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PolP11369 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PolP11369 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PolP11369 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PolP11369 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PolP11369 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PolP11369 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PolP11369 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PolP11369 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PolP11369 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PolP11369 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PolP11369 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PolP11369 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PolP11369 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PolP11369 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PolP11369 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PolP11369 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PolP11369 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PolP11369 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PolP11369 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PolP11369 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PolP11369 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PolP11369 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PolP11369 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PolP11369 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PolP11369 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PolP11369 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PolP11369 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PolP11369 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PolP11369 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PolP11369 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PolP11369 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PolP11369 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PolP11369 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PolP11369 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PolP11369 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PolP11369 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PolP11369 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PolP11369 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PolP11369 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PolP11369 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
PolP11369 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PolP11369 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PolP11369 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PolP11369 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PolP11369 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PolP11369 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PolP11369 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PolP11369 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PolP11369 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PolP11369 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PolP11369 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PolP11369 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PolP11369 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PolP11369 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PolP11369 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PolP11369 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PolP11369 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PolP11369 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PolP11369 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PolP11369 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PolP11369 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PolP11369 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PolP11369 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PolP11369 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PolP11369 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PolP11369 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PolP11369 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PolP11369 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PolP11369 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PolP11369 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PolP11369 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PolP11369 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PolP11369 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PolP11369 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PolP11369 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PolP11369 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PolP11369 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PolP11369 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PolP11369 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99 ms