Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prf1P10820 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prf1P10820 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prf1P10820 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prf1P10820 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prf1P10820 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prf1P10820 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prf1P10820 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prf1P10820 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prf1P10820 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prf1P10820 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prf1P10820 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms