Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P10404 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P10404 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P10404 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P10404 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P10404 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P10404 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P10404 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P10404 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
P10404 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P10404 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P10404 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P10404 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
P10404 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P10404 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P10404 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P10404 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P10404 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P10404 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P10404 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P10404 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P10404 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P10404 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P10404 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P10404 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P10404 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P10404 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P10404 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P10404 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P10404 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P10404 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P10404 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P10404 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P10404 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P10404 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P10404 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P10404 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P10404 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P10404 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P10404 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P10404 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P10404 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P10404 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P10404 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P10404 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P10404 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P10404 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P10404 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P10404 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P10404 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P10404 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P10404 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P10404 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P10404 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P10404 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P10404 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P10404 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P10404 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P10404 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P10404 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P10404 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P10404 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P10404 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P10404 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P10404 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P10404 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
P10404 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P10404 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
P10404 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P10404 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P10404 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P10404 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P10404 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P10404 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P10404 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P10404 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P10404 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P10404 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P10404 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P10404 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P10404 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P10404 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P10404 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P10404 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P10404 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P10404 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P10404 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P10404 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P10404 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P10404 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P10404 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P10404 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P10404 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
P10404 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
P10404 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
P10404 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P10404 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P10404 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P10404 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P10404 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms