Protein–RNA interactions for Protein: P0DN90

Tmem254b, Transmembrane protein 254b, mousemouse

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Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254bP0DN90 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem254bP0DN90 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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