Protein–RNA interactions for Protein: P0C1V4

Tmco2, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco2P0C1V4 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms