Protein–RNA interactions for Protein: P09926

Surf2, Surfeit locus protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf2P09926 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf2P09926 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf2P09926 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf2P09926 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf2P09926 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf2P09926 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf2P09926 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf2P09926 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf2P09926 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf2P09926 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf2P09926 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms