Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtaP09225 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtaP09225 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtaP09225 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
LtaP09225 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtaP09225 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
LtaP09225 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtaP09225 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
LtaP09225 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtaP09225 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtaP09225 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtaP09225 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtaP09225 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtaP09225 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtaP09225 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtaP09225 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtaP09225 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtaP09225 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtaP09225 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtaP09225 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtaP09225 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtaP09225 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtaP09225 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtaP09225 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtaP09225 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
LtaP09225 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LtaP09225 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
LtaP09225 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LtaP09225 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LtaP09225 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
LtaP09225 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LtaP09225 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LtaP09225 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LtaP09225 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LtaP09225 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LtaP09225 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LtaP09225 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LtaP09225 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LtaP09225 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LtaP09225 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LtaP09225 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LtaP09225 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LtaP09225 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LtaP09225 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LtaP09225 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LtaP09225 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LtaP09225 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LtaP09225 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LtaP09225 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LtaP09225 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LtaP09225 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LtaP09225 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LtaP09225 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LtaP09225 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LtaP09225 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
LtaP09225 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LtaP09225 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LtaP09225 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LtaP09225 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LtaP09225 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LtaP09225 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LtaP09225 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LtaP09225 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LtaP09225 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LtaP09225 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LtaP09225 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LtaP09225 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LtaP09225 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LtaP09225 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LtaP09225 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LtaP09225 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LtaP09225 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LtaP09225 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LtaP09225 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LtaP09225 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LtaP09225 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LtaP09225 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LtaP09225 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LtaP09225 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LtaP09225 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LtaP09225 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LtaP09225 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LtaP09225 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LtaP09225 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LtaP09225 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LtaP09225 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LtaP09225 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LtaP09225 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LtaP09225 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LtaP09225 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LtaP09225 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LtaP09225 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LtaP09225 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LtaP09225 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LtaP09225 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LtaP09225 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LtaP09225 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LtaP09225 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LtaP09225 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LtaP09225 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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