Protein–RNA interactions for Protein: P08046

Egr1, Early growth response protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr1P08046 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Egr1P08046 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Egr1P08046 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Egr1P08046 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Egr1P08046 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Egr1P08046 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Egr1P08046 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Egr1P08046 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Egr1P08046 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Egr1P08046 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Egr1P08046 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Egr1P08046 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Egr1P08046 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Egr1P08046 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Egr1P08046 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Egr1P08046 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Egr1P08046 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Egr1P08046 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Egr1P08046 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Egr1P08046 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Egr1P08046 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Egr1P08046 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Egr1P08046 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Egr1P08046 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Egr1P08046 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Egr1P08046 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Egr1P08046 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Egr1P08046 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Egr1P08046 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Egr1P08046 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Egr1P08046 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Egr1P08046 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Egr1P08046 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Egr1P08046 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Egr1P08046 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Egr1P08046 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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