Protein–RNA interactions for Protein: P06339

H2-T23, H-2 class I histocompatibility antigen, D-37 alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-T23P06339 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-T23P06339 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms